Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms