Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms