Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GDE1Q9NZC3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GDE1Q9NZC3 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GDE1Q9NZC3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GDE1Q9NZC3 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GDE1Q9NZC3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GDE1Q9NZC3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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