Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms