Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XAB2Q9HCS7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms