Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms