Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms