Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms