Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms