Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms