Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms