Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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