Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms