Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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