Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms