Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms