Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF25Q9BQ70 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms