Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms