Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLIP3Q96DZ5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLIP3Q96DZ5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP3Q96DZ5 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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