Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms