Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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SPTSSAQ969W0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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SPTSSAQ969W0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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SPTSSAQ969W0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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SPTSSAQ969W0 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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