Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HDAC10Q969S8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HDAC10Q969S8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HDAC10Q969S8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HDAC10Q969S8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HDAC10Q969S8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC10Q969S8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms