Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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USP9XQ93008 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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USP9XQ93008 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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USP9XQ93008 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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USP9XQ93008 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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