Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms