Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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COPS9Q8WXC6 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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COPS9Q8WXC6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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COPS9Q8WXC6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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COPS9Q8WXC6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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COPS9Q8WXC6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PTCHD1-201ENST00000379361 13714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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