Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SELENOMQ8WWX9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SELENOMQ8WWX9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms