Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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