Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPNTQ6UXI9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPNTQ6UXI9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms