Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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SAPCD1Q5SSQ6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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