Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms