Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL22Q53GT1 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms