Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms