Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETM2Q2VYF4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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