Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 350.1 ms