Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms