Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PIGM-201ENST00000368090 4319 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RIN2-201ENST00000255006 4505 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 GREB1L-202ENST00000424526 6052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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