Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms