Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SS18Q15532 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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SS18Q15532 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SS18Q15532 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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