Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEUROD1Q13562 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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