Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB3Q13509 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB3Q13509 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB3Q13509 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms