Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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