Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1AQ13111 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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