Protein–RNA interactions for Protein: Q12962

TAF10, Transcription initiation factor TFIID subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF10Q12962 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF10Q12962 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms