Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PTPRJQ12913 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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