Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFCP2Q12800 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFCP2Q12800 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms