Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms