Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms