Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms