Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU5F1Q01860 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms