Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms